干貨滿滿丨博奧晶典單細胞測序技術(shù)應(yīng)用培訓(xùn)班圓滿落幕
日期:2019-06-20 來源:

? ? ? ? 日前,由北京博奧晶典生物技術(shù)有限公司(以下稱“博奧晶典”)主辦的“單細胞測序技術(shù)應(yīng)用培訓(xùn)班”在上海圓滿落幕。來自全國各地近百位老師參加了此次培訓(xùn),現(xiàn)場座無虛席。此次培訓(xùn)課程根據(jù)老師們的實際需求進行了優(yōu)化,增加了植物單細胞消化經(jīng)驗分享及數(shù)據(jù)分析思路、單細胞Loupe可視化軟件個性化操作及高級分析軟件的應(yīng)用等內(nèi)容,旨在傳遞單細胞測序最新最熱的研究內(nèi)容。

培訓(xùn)現(xiàn)場盛況

博奧晶典科研服務(wù)事業(yè)部產(chǎn)品講師

? ? ? ? 本次培訓(xùn),各位講師介紹了10x Genomics單細胞測序平臺及BD Rhapsody單細胞平臺的相關(guān)技術(shù),包括10x Genomics單細胞轉(zhuǎn)錄組測序、10x Genomics單細胞免疫組庫測序、10x Genomics單細胞ATAC、細胞表面蛋白及空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù),以及BD單細胞WTA檢測、TTA檢測、混樣及細胞表面蛋白檢測技術(shù)。從平臺介紹及常用研究工具分享到高分及重點應(yīng)用案例解析,讓大家對單細胞測序技術(shù)有一個更全面的了解,參加培訓(xùn)的老師們都表現(xiàn)出濃厚的興趣。

培訓(xùn)班亮點

? ? ? ? 本次培訓(xùn)有幸邀請到了發(fā)表在Molecular Plant雜志上的國內(nèi)首篇植物單細胞文章共同一作,中科院植物生理生態(tài)研究所張?zhí)炱娌┦亢托熘薷┦俊?/span>

張?zhí)炱娌┦?/span>

? ? ? ? 張?zhí)炱娌┦吭@中國科協(xié)青年人才托舉工程、中國博士后創(chuàng)新人才支持計劃、Sanofi-SIBS青年人才獎學(xué)金等資助。具有豐富的植物單細胞實驗和數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗。多篇研究論文以第一作者發(fā)表在Plant CellMolecular Plant學(xué)術(shù)期刊上。此次報告,張?zhí)炱娌┦酷槍λ鳛楣餐蛔靼l(fā)表的國內(nèi)首篇植物單細胞文章做了詳細介紹,并對實驗的研究背景、設(shè)計思路、實驗方案的實施以及實驗開展期間發(fā)現(xiàn)的問題和解決方案做了細致分享,老師們紛紛表示受益匪淺。

徐洲更博士

? ? ? ? 徐洲更博士主要研究植物基因組和單細胞轉(zhuǎn)錄組。從3年前開始在簡書和微信公眾號上發(fā)表關(guān)于轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析的內(nèi)容,目前文章總閱讀次數(shù)近百萬。出于個人對生物信息的熱愛,獨立在一個實驗室搭建了生物信息學(xué)分析平臺。此次報告,徐洲更博士針對他作為共同一作發(fā)表的國內(nèi)首篇植物單細胞文章的數(shù)據(jù)分析及常用生物信息學(xué)軟件做了詳細介紹,解決了大家在單細胞數(shù)據(jù)分析過程中存在的許多困惑。徐洲更博士風(fēng)趣幽默的表達方式也為培訓(xùn)班增添了更多活力。

博奧晶典測序平臺技術(shù)總監(jiān)劉杰博士

? ? ? ? 博奧晶典測序平臺技術(shù)總監(jiān)劉杰博士為大家?guī)砹藛渭毎麘腋∫褐苽浜陀嫈?shù)經(jīng)驗分享。包括不同組織單細胞懸浮液的制備以及如何保證更穩(wěn)定的細胞產(chǎn)出,并一一解答了各位老師在前處理過程中遇到的問題,讓老師們對樣品制備的重要性有了更清晰的認識。

博奧晶典生物信息工程師彭巖博士

? ? ? ? 博奧晶典生物信息工程師彭巖博士,為各位老師帶來了單細胞轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)分析思路及常用軟件的介紹和實操訓(xùn)練。包括Loupe可視化軟件的個性化操作,單細胞高級數(shù)據(jù)分析軟件操作以及互作網(wǎng)絡(luò)圖的繪制等。幫助各位老師更好的進行后續(xù)數(shù)據(jù)挖掘,以期滿足不同研究方向的個性化科研需求。

博奧晶典希望通過這一天的培訓(xùn)

對各位老師今后的科研學(xué)習(xí)有所幫助

同時博奧晶典誠邀更多的老師參與到培訓(xùn)中來

在這里收獲滿滿、快樂滿滿

本次培訓(xùn)班完美落幕

感謝老師們的參與和支持


培訓(xùn)班精彩瞬間


培訓(xùn)班合影

培訓(xùn)班現(xiàn)場互動討論

? ? ? ? 本次培訓(xùn)沒有報上名的老師不用桑心,如果想要學(xué)習(xí)單細胞測序數(shù)據(jù)下機后常用的分群軟件Cell ranger、多樣品比較分析軟件AGGR的操作流程以及操作中的注意事項;結(jié)果可視化軟件loupe可以實現(xiàn)的功能及操作流程;以及一些常用的數(shù)據(jù)挖掘R包和軟件,如:擬時間序列分析、細胞互作分析及不同樣品相同亞群間如何進行差異比較分析等。歡迎參加6月29日在北京舉辦的“第二屆單細胞測序技術(shù)高端研討會”。

延伸閱讀

? ? ? ? 博奧晶典作為國內(nèi)第一批引進10x Genomics平臺的公司,率先在國內(nèi)開展上萬級通量的單細胞轉(zhuǎn)錄組測序服務(wù)。目前已經(jīng)完成了2000多個樣品、100多種不同樣品類型的服務(wù),覆蓋的物種和樣品類型包括人和小鼠的肝臟、肺臟、皮膚、心臟、腦、腎臟、血液、卵巢、神經(jīng),以及雞、斑馬魚、豬、水稻、擬南芥、油菜、白菜、橄欖等,是目前國內(nèi)大規(guī)模單細胞測序經(jīng)驗豐富的公司。

? ? ? ??博奧晶典于2018年9月與BD(中國)成立單細胞研究聯(lián)合實驗室,致力于大規(guī)模單細胞測序產(chǎn)品的開發(fā)和打磨,目前可開展如下單細胞測序產(chǎn)品和服務(wù)。