2018年9月25日,北京博奧晶典生物技術(shù)有限公司(以下簡稱“博奧晶典”)攜手BD(中國)(以下簡稱“BD”) 成立的博奧晶典—BD(中國)單細胞研究聯(lián)合實驗室舉行揭牌儀式,并簽署戰(zhàn)略合作協(xié)議。BD全球市場總監(jiān)Nikhil Rao,BD大中華區(qū)基因組業(yè)務(wù)部負責(zé)人於莉,BD基因組產(chǎn)品經(jīng)理武鑫,博奧晶典產(chǎn)品研發(fā)中心技術(shù)總監(jiān)潘良斌博士,博奧晶典科研服務(wù)事業(yè)部總經(jīng)理孟晨等出席揭牌儀式。
簽約儀式上,BD全球市場總監(jiān)Nikhil Rao與博奧晶典產(chǎn)品研發(fā)中心技術(shù)總監(jiān)潘良斌博士為實驗室成立進行了揭牌儀式并簽約,該實驗室的建立旨在單細胞研究領(lǐng)域開展合作,共推單細胞測序技術(shù)進入臨床轉(zhuǎn)化新時代。
博奧晶典-BD(中國)單細胞研究聯(lián)合實驗室,匯集了BD的Rhapsody單細胞測序分析系統(tǒng),博奧晶典的單細胞懸液制備體系和生物信息研究院團隊,依托BD(中國)與博奧晶典多年臨床轉(zhuǎn)化的經(jīng)驗,為單細胞測序技術(shù)進入臨床轉(zhuǎn)化準備好了天時、地利、人和的沃土。聯(lián)合實驗室基于單細胞檢測技術(shù),開展單細胞靶向基因測序、單細胞蛋白檢測、TCR/BCR檢測, 共同開發(fā)國際一流的用于腫瘤、心血管疾病診療應(yīng)用的單細胞檢測panel,為疾病診斷、預(yù)后評估等提供有效參考。
單細胞測序技術(shù)臨床轉(zhuǎn)化
2009年單細胞測序技術(shù)問世,2015年及以后隨著Drop-seq、Micro-well、Split-seq等技術(shù)的出現(xiàn),徹底降低了單細胞測序的成本門檻。單細胞測序技術(shù)被廣泛應(yīng)用于基礎(chǔ)科研和臨床研究,相應(yīng)成果也備受CNS青睞,如雨后春筍般頻頻出現(xiàn)在高分雜志。單細胞測序技術(shù)的研究成果涉及到腫瘤分型、靶向用藥、免疫治療,動植物胚胎發(fā)育,心血管疾病的發(fā)生發(fā)展機制等眾多領(lǐng)域。
2017年,作為單細胞測序技術(shù)臨床應(yīng)用的拓荒者,耶魯大學(xué)樊榮教授將單細胞測序技術(shù)應(yīng)用于CART-T治療的監(jiān)測,他指出,“通過單細胞水平的檢測,預(yù)測腫瘤的發(fā)展趨勢,我們就有機會從整體水平上為患者制定更好的治療方案。”為我們將單細胞測序技術(shù)應(yīng)用于臨床帶來了思路和方向。
Rhapsody采用“分子標簽”技術(shù),基于微孔的原理,其卡式芯片可以在寡核苷酸條形碼標記的磁性微球上,實現(xiàn)單細胞捕獲和mRNA的反轉(zhuǎn)錄。然后通過磁鐵將這些微球吸出合并到單個管中用于cDNA擴增和文庫構(gòu)建。構(gòu)建好的文庫使用Illumina測序平臺對文庫進行測序檢測,即可一次性獲得100~10000個單細胞的基因表達數(shù)據(jù),從而實現(xiàn)在單細胞水平進行基因表達測序的目的。
BD Raphsody單細胞分選原理
Rhapsody 三大優(yōu)勢助力臨床轉(zhuǎn)化
1、每個panel可以選擇100~1000個靶向基因,靈活訂制。
靶向方法有助于提高單細胞測序效率,并推動對當今一些最具挑戰(zhàn)性的科學(xué)領(lǐng)域的進一步探索。經(jīng)驗證的檢測試劑盒(panel)顯示穩(wěn)定且可重現(xiàn)的細胞異質(zhì)性陣列,可用于探索與眾多應(yīng)用相關(guān)的細胞類型。用戶可根據(jù)需求定制引物,將檢測范圍集中在目標基因,大幅降低后續(xù)測序成本。目前已經(jīng)推出了乳腺癌、免疫反應(yīng)和T細胞三個靶向基因的檢測Panel。
BD 單細胞靶向基因捕獲原理
2、樣品標記技術(shù)提高樣品通量、同時降低建庫成本。
Raphsody系統(tǒng)通過細胞表面通用蛋白的抗體與細胞表面的蛋白進行反應(yīng), 抗體的尾端加了一段樣品標簽和polyA組成的核酸序列(圖3),此段核酸序列與單個細胞的mRNA一起進行反轉(zhuǎn)錄和測序。在得到測序數(shù)據(jù)后通過分析樣品標簽序列,從而對細胞進行樣品來源的追蹤。
基于該檢測原理,一次實驗最多可以同時混合12個樣品進行單細胞測序?qū)嶒?,大大降低了單細胞測序的建庫費用,進而降低了科研成本。
樣品標記的原理
3、轉(zhuǎn)錄組與蛋白的聯(lián)合研究,單細胞多組學(xué)研究的開創(chuàng)性技術(shù)。
mRNA在翻譯成蛋白的過程,往往會發(fā)生轉(zhuǎn)錄后調(diào)控,而出現(xiàn)mRNA的變化趨勢與蛋白不一致甚至相反的趨勢。同時進行mRNA與蛋白的聯(lián)合檢測有利于我們更為完善的檢測細胞內(nèi)的分子信息,尋找到轉(zhuǎn)錄后調(diào)控的信息、mRNA的可變剪切信息、并通過2種分子的聯(lián)合檢測進一步提高細胞分群的解析度。
其檢測原理主要是通過多種帶有核酸序列的抗體與細胞同時發(fā)生反應(yīng),帶有相應(yīng)蛋白的細胞表面通過抗原抗體特異性結(jié)合作用而結(jié)合了相應(yīng)的抗體,接下來對結(jié)合在細胞表面的抗體尾端的核酸序列和mRNA同時進行文庫構(gòu)建和測序工作。拿到測序數(shù)據(jù)后,通過數(shù)據(jù)分析抗體尾端核酸序列的信息,來獲取單個細胞表面蛋白的信息,通過分析mRNA文庫信息,獲取單個細胞內(nèi)基因表達的信息,從而實現(xiàn)同時獲取單個細胞內(nèi)mRNA和細胞表面蛋白的信息的目的。
單細胞mRNA與蛋白聯(lián)合檢測原理